Il neonato colpito può apparire pletorico o può presentare segni neurologici (p. es., convulsioni, letargia, scarsa alimentazione) o distress cardiorespiratorio (p. es., tachipnea, tachicardia, cianosi). Il neonato sintomatico con Htc venoso centrale > 65% deve essere sottoposto a un'exsanguinotrasfusione parziale, mediante la quale una parte del sangue è rimossa e sostituita con un uguale volume di plasma o di soluzione fisiologica per ridurre l'Htc a livelli di sicurezza. Attenzione: la semplice flebotomia, da sola, non deve essere utilizzata, poiché determina ipovolemia e la sintomatologia può peggiorare. La supposta associazione fra policitemia neonatale e successivo ritardato sviluppo non è stata provata.